En préalable au débat public de l'automne 2006, une série d'études dites « pré-études fonctionnelles », a été réalisée. Conduites de 2004 à 2006 par Réseau Ferré de France, ces études ont eu pour objectif de définir les premières caractéristiques du projet.
Elles ont porté sur différents aspects et se sont déclinées comme suit :
Ces études ont permis la production de données chiffrées, d'informations et d'analyses, sur la base desquelles a eu lieu le débat public.